第一、發生在減數第一次分裂的間期，同源染色體的非姐妹染色單體的交叉互換。第二、發生在減數第一次分裂後期。還有第三個就是基因工程裡面的，插入外來的基因。
基因重組發生的時期
1.因重組指在生物體進行有性生殖的過程中，控制不同性狀的基因重新組合。其發生在二倍體生物的每個時代中。
2.在減數分裂的第一次分裂後期，隨著非同源染色體的自由組合，非等位基因也自由組合；在減數分裂的四分體期，由於非姐妹染色單體的交叉互換，打破瞭原有基因的連鎖關系而產生基因重組；重組DNA技術，在DNA復制時，沒有基因組合的改變。
作物抗逆性品種、高產品種定向選育，重組抗原抗體制備，重組蛋白表達，工業微生物育種，科學研究等。基因的自由組合（發生在減數第一次分裂後期）、基因的交叉與互換（發生在減數第一次分裂前期）、基因工程和細菌轉化（如肺炎雙球菌由R型轉化為S型）。其中，前兩種是狹義的基因重組，後兩種是廣義的基因重組。
基因重組各類型的意義
是生物變異的重要因素,是生物進化重要因素之一。
1.同源染色體之間的非姐妹染色單體的交叉互換，同源染色體的非姐妹染色單體在前期聯會。
2.非同源染色體上的非等位基因的自由組合，減一後期，同源染色體上的等位基因分離，同時非同源染色體上的非等位基因自由組合
（1）接合作用：當細胞與細胞、或細菌通過菌毛相互接觸時，質粒DNA就可從一個細胞（細菌）轉移至另一細胞(細菌），這種類型的DNA轉移稱為接合作用（conjugation ）。
